相关性

作者: YX_Andrew | 来源:发表于2019-08-04 12:51 被阅读3次

    统计学中, 以查尔斯·斯皮尔曼命名的斯皮尔曼等级相关系数,即spearman相关系数。经常用希腊字母ρ表示。 它是衡量两个变量依赖性的 非参数 指标。 它利用单调方程评价两个统计变量的相关性。 如果数据中没有重复值, 并且当两个变量完全单调相关时,斯皮尔曼相关系数则为+1或−1。

    Mantel test 分析两个距离矩阵之间的相关性

    做微生物菌落少不了分析环境因子(pH,有机碳,总氮,盐度等)与菌落的相关性,此时便需要做CCA和Mantel test 分析。有时CCA分析结果可能难以比较,这时候做一下Mantel test 进行分析可以直观的根据所求 r值和显著性水平P值来对环境因子和微生物菌落分布相关性有个大致了解。

    【1】​ Hollister EB, Engledow AS, Hammett AJ, Provin TL, Wilkinson HH, Gentry TJ. Shifts in microbial community structure along an ecological gradient of hypersaline soils and sediments. The ISME journal 2010;4:829-38.

    【2】​Yang J, Ma La, Jiang H, Wu G, Dong H. Salinity shapesmicrobial diversity and community structure in surface sediments of theQinghai-Tibetan Lakes. Scientific Reports 2016;6.

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