ggplot2标注P值的方法有很多种,大多比较繁琐,今天发现一种简便的!!!
ggrism是ggplot2的扩展包,熟悉 GraphPad Prism小朋友应该知道,这个包是在R中实现 GraphPad Prism图形的包,可以改为Prism形式的坐标轴、颜色、填充等。
这都不是重点,这里重点介绍一下它为ggplot图形添加P值的功能。
加载包
library(ggplot2)
library(ggprism)
library(patchwork)
做一个P值的表
df_p_val <- data.frame(
group1 = "OJ",
group2 = "VC",
p.adj = 0.0606,
y.position = 36
)
绘图
p1 <- ggplot(ToothGrowth, aes(x = factor(supp), y = len)) +
geom_boxplot(aes(fill = factor(supp))) +
scale_fill_prism(palette = "candy_bright") +
theme_prism() +
theme(legend.position = "none")
加P值
p2 <- p1 + add_pvalue(df_p_val)
p1 + p2
image.png
感觉简单易行,比添加segment的线好多了!
(人太懒了,就得找懒办法)
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