4.6 近亲交配和亲缘关系

4.6.1 血缘关系

通常来说，个体之间的关系是通过他们共享的血液量来呈现的，显然这样的说法不准确，但可以间接地理解为有多少来自共同祖先的部分。兄弟姐们间很相似，因为每个个体都继承了各一半来自父母双方的遗传物质。在同一个群体中，两个个体之间的关系简单说是相比没有关系的其他个体他们可以分享更多的遗传物质。因为它们通过血脉连接起来。

一个动物可以说是百分之百与自己相关，父母和子女的关系是百分之五十，因为每个后代从各自父母那里得到了一半的遗传物质。而在近交群体中，父母与子代的关系将高于百分之五十。

全同胞之间最可能的关系是50%，因为他们四分之一的遗传物质将从他们共同的父系获得，另四分之一将从他们共同的母系获得。全同胞之间的关系可能存在差异，因为机会法则可能导致一些同胞对从父系或母系获得超过四分之一的遗传物质作为复制品。平均来说，半同胞个体有25%的亲缘关系，因为他们的四分之一的遗传物质是来自共同父母的复制品。（Fig.4.11）

4.11

Wright (1921) 提出了建立亲属关系的路径追踪概念，并引入了关系系数R。关系示例如图4.11所示。此外，这一数字还可以扩大，表明动物与其曾祖父母之间的关系系数为0.125，表亲之间的关系系数为0.0625。
由于孟德尔遗传的减半性降低了每一代的亲缘关系水平，因此个体间的亲缘关系比表兄妹间的亲缘关系更为疏远，几乎没有实际意义。如果其中一个祖先是近亲繁殖的，这种关系将跟明显。

4.6.2 近交

近交的广义定义是由彼此通过祖先相连的个体交配，这种交配使得后代比亲本更加纯合，实际上，近交一词的使用在某种程度上取决于交配的紧密程度和特定育种背景，通常认为，父母和子代之间，同胞之间以及半同胞之间的交配为近交，第一表亲和第二表亲的交配并不算为近交，植物育种者通常可能只将自体受精视为近亲繁殖。在大多数育种计划中，较弱的关系也被认为是近交，因为如果封闭群体中的交配持续了很多代，这种水平的近交结果将会累积。在繁殖力很高的鱼类和贝类物种中，近交繁殖的风险非常高，因为其高繁殖力，繁殖一代个体只需要很少的亲本，

近交通常由近交系数（F）来衡量，这是Wright在1921年引入的一个术语。具其定义为，近交系数是指配子基因效应间的相关，用F表示，Malecot（1948）进一步将近交系数定义为一个个体同一基因座上的两个基因为血缘同源的概率。对于一个特定的基因座，两个基因可能是也可能不是血缘同源。但对所有基因座，近交系数意味着可以预期有比例等于F的基因座携带血缘同源基因。

当N个繁殖个体随机交配（包括随机的自交）而没有近亲繁殖时，群体被认为处于平衡状态。进一步假设每个位点有两个等位基因，群体中的等位基因总数为2N。随机抽取的两个配子携带相同基因的概率为1/2N。根据（Falconer和Mackay 1966）“任何配子都有（1/2N）机会与另一个同类配子结合，所以1/2N是联合配子携带相同基因的概率，因此也是后代近交的系数。

基本群体可被认为是没有近亲繁殖的0代。第一代后代的近亲繁殖系数如下：