JCVI的使用基本格式为python -m jcvi.模块.子功能 实际操作
,因此了解JCVI的模块能够帮助我们去找到需要的功能。根据JCVI的源代码,我们可以知道它目前一共有10个模块,如下
algorithms: 算法模块

annotation: 注释模块

assembly: 组装模块

compara: 比较基因组学模块

projects: 之前的一些项目代码

utils: 一些实用脚本

variation: 变异检测模块

apps: 常用程序的封装

formats: 各种模式的转换

绘图模块: 用来绘制一些常用的图。

不同模块可能有不同的依赖,所以第一次使用的时候需要配置对应的环境。
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