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从R中安装phylotaR包经验

从R中安装phylotaR包经验

作者: 雨林课堂 | 来源:发表于2021-02-25 10:33 被阅读0次

    1. 在RStudio中设置镜像为国内清华大学镜像;

    2. 安装Rtools工具至PATH

    从R 4.0.0(2020年4月发布)开始,R for Windows使用了一个全新的工具链捆绑包rtools40。

    3. 安装phylotaR包,参考链接如下
    https://github.com/ropensci/phylotaR

    From CRAN:

    install.packages('phylotaR')

    Or, download the development package from GitHub:

    devtools::install_github(repo='ropensci/phylotaR',build_vignettes=TRUE)

    Full functionality depends on a local copy of BLAST+ (>= 2.0.0). For details on downloading and compiling BLAST+ on your machine please visit the NCBI website.

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