• 下载UCSC数据
  点击Downloads，选择Genome Data ;点击Mammals，找到M_musculus,选择合适版本，进入Full data set下载chromfa.tar.gz（该文件是基因组文件的打包），或进入Data set by chromsome文件中下载各条染色体序列，在合并。
• 下载NCBI下genome中基因组数据：ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/genomes/M_musculus/
• Ensembl中基因组数据下载：http://www.ensembl.org/info/data/ftp/index.html

参考基因组注释文件准备

GENCODE（http://www.gencodegenes.org/）中有小鼠基因组注释文件；
Data->Mouse->Release History : 找到对应我们先前下载的GRCm38版本，这儿下载M11，这个数据的对应版本是不断更新的；

作者：eason
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来源：简书
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