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当质谱流式撞见免疫代谢

当质谱流式撞见免疫代谢

作者: 生信宝库 | 来源:发表于2021-12-24 09:34 被阅读0次

    1.前言

    纵观近几年的免疫圈,除了受新冠疫情影响而火热的机体抗病毒的免疫机制研究之外,那就是各种免疫细胞的代谢研究了,我们可以时不时的在各大科研平台看到免疫代谢研究的重大报道。这个研究方向的崛起绝非偶然,因为代谢组学被誉为起步最难的组学,而免疫学又被认为是最复杂的基础医学研究领域之一,由这两位“大佬”碰面产生的故事那当然是有的说了。

    虽然代谢组学和免疫学均是科研界难啃的骨头,但因为这两个领域研究的工作者众多,各项技术都还较为成熟,如代谢组学研究的各种质谱技术、免疫学研究所用的流式技术,这些都在随着技术的更新换代而迅速发展,于是跟着这股潮流一个新的技术就产生了—-质谱流式

    2.质谱流式的优势

    虽然话是这么说的,名字也很巧合,但是质谱流式最初被发明出来不是为了研究免疫细胞的代谢,而是为了解决研究者在进行多色流式实验时难以解决的补偿问题。光谱流式在发展过程中,渐渐表现出一些缺陷,主要表现为荧光染料的限制,即使方案经过精心设计,也无法避免光谱渗漏、自发荧光等问题,使用的荧光染料的数量越多,补偿问题就越大。

    图1:光谱流式和质谱流式的参数对比

    3.免疫细胞代谢的特征

    研究发现,免疫细胞在抗原被激活时,会优先通过供能更加迅速的糖酵解代谢,消耗丙酮酸并产生乳酸,而不是通过周期更长的TCA循环产生能量。此外,TCA中间体琥珀酸的积累还能促进HIF-1α的稳定表达从而启动糖酵解代谢途径;同时,积累的柠檬酸可以作为抗炎代谢物--亚甲基丁二酸的前体物质。糖酵解过程也可为戊糖磷酸途径(PPP)提供燃料,生成核苷酸、氨基酸和NADPH, NADPH等,这些物质又可与柠檬酸一起用于合成脂肪酸。另一方面,氧化脂肪酸可驱动线粒体进行有氧代谢,这种代谢方式在耐受性免疫细胞中比在其他细胞中更为突出。

    图2:激活状态下免疫细胞的代谢需求

    4.质谱流式研究免疫细胞代谢的优势

    细胞代谢研究中一个常用的实验就是—Seahorse,其利用高灵敏度的细胞外氧气与H+流量变化检测技术,实时完成细胞内两条主要能量产生途径——线粒体呼吸和糖酵解的测量,通过测定细胞外酸化率(ECAR:Extracellular Acidificarion Rate)和氧气消耗速率(OCR:Oxygen Consumption Rate),可以较为准确的获得细胞有氧呼吸与糖酵解的基础水平,最高/最低水平及能量储备水平等实验结果。但Seahorse实验对细胞状态要求很高,而且需要十万级细胞数量,但是其计算的却是所有实验细胞的一个平均水平;同时,其只能测得细胞有氧和无氧两大类代谢水平,而不能分辨如有氧代谢中的脂肪酸代谢等。

    图3:Seahorse实验测量免疫细胞代谢

    相比之下,质谱流式通过同时标记几十种代谢关键酶,可以在单个细胞水平评估各种细胞的代谢状态,如评估细胞糖酵解谱的酶:p4EBP1, pS6, HIF1a, Glut1和 GAPDH;氧化代谢谱的酶:CS, ATP5a, VDAC1和 CytoC;脂肪酸氧化的酶:CPT1a, HADHA 和 ACADM;甚至和长链脂肪酸代谢相关的酶p-p38, pCREB, pERK和NRF1等。

    图4:质谱流式标记代谢关键酶

    5.小结

    质谱流式细胞技术结合质谱技术和传统光谱流式细胞技术,大大增多了可检测的参数,并无需补偿,弥补了荧光流式技术上的不足。不过,质谱流式吞吐量小、细胞利用率低、金属同位素灵敏性较低等的不足是质谱流式未来需要客服的缺点。尽管如此,质谱流式拥有强大的单细胞水平分辨率,并且可同时标记几十种代谢关键蛋白,从而为免疫细胞的代谢研究提供强大的技术支撑。

    [参考文献]

    1. Levine LS,Hiam-Galvez KJ, Marquez DM, Tenvooren I, Madden MZ, Contreras DC, Dahunsi DO,Irish JM, Oluwole OO, Rathmell JC, Spitzer MH. Single-cell analysis by masscytometry reveals metabolic states of early-activated CD8+ T cells during theprimary immune response. Immunity. 2021 Apr 13;54(4):829-844.e5. doi:10.1016/j.immuni.2021.02.018.

    2.Chou WC, RampanelliE, Li X, Ting JP. Impact of intracellular innate immune receptors onimmunometabolism. Cell Mol Immunol. 2021 Oct 25. doi:10.1038/s41423-021-00780-y.

    3.光谱流式与质谱流式之“争 ”https://www.antpedia.com/news/70/n-2564170.html

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