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学习小组D3 linux安装软件-高岭之猹

学习小组D3 linux安装软件-高岭之猹

作者: 高岭之猹 | 来源:发表于2022-04-16 17:34 被阅读0次

    具体过程参考:day3-linux环境下的软件安装 - UMU互动学习平台

    查看服务器版本 uname -a

    下载miniconda 清华:wget 后跟下载链接,下载.sh的那个最新版本

    https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/miniconda/Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh

    本次安装问题

    安装软件 conda install fastqc -y 时 报错
    image.png
    "No space left on device" 磁盘空间提示不足解决办法
    df -h 查看磁盘空间

    可看出磁盘空间已满!
    df -i 查看inode空间

    inode空间未满
    附:磁盘空间和inode空间的概念

    linux中,有两个概念,就是block和inode,block:用于存放实际数据,inode:存放文件属性,只要这两个其中一个占满空间了,都会导致提示报错“磁盘空间不足”

    解决: 小伙伴删了点硬盘文件。。。并建议用mnt

    进阶:创建新conda环境

    意义:

    生信实战中,需要分析转录组、基因组组装、重测序等多个项目。
    每一个项目都需要不同的软件,另外软件之间的结合也是需要版本要求的,比如A项目你需要用a软件V 1.0版本,但是处理B项目又需要用到a软件的V 1.5版本,怎么办?
    --别想了,办法就是分身!!按照你的项目,定制不同的分身,安装不同的软件,互不干扰。这个分身就是不同的“conda environment”。

    参考:day3-linux环境下的软件安装 - UMU互动学习平台

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