centos-hdf5r安装

wget https://support.hdfgroup.org/ftp/HDF5/releases/hdf5-1.10/hdf5-1.10.5/src/hdf5-1.10.5.tar.gz
tar xvf hdf5-1.10.5.tar.gz
cd hdf5-1.10.5
./configure --prefix=/usr/local/hdf5
make
make check
sudo make install 
sudo make check-install

sudo vi /etc/ld.so.conf

# 给文件中添加一行：/usr/local/hdf5/lib

sudo ldconfig
# echo "dyn.load('/usr/local/hdf5/lib/libhdf5_hl.so.100')" >> ~/.Rprofile 
## dyn.load('/usr/local/hdf5/lib/libhdf5_hl.so.100')

ld.so.conf 文件在类 Unix 操作系统中用于配置动态链接器，特别是指定程序运行时动态链接器搜索共享库（动态库）的路径。

修改 ld.so.conf 文件可以让系统找到并链接共享库的原因有：

1. 库搜索路径：
   ld.so.conf 包含了一系列目录，这些目录是动态链接器搜索共享库的路径。当程序启动时，动态链接器会查看这个文件，通过列出的路径寻找需要的库文件。

2. 添加新路径：
   如果安装了一个新软件或者库，而该库不在默认的库搜索路径中，就需要将含有该库的目录路径添加到 ld.so.conf 文件中，这样动态链接器才能找到并加载它。

3. 更新链接器缓存：
   修改 ld.so.conf 后，需要运行 ldconfig 命令来更新动态链接器的缓存。ldconfig 会读取 ld.so.conf 文件，并实际检查其中列出的目录，然后创建或更新 /etc/ld.so.cache 文件。这个缓存文件加速了动态链接器搜索和加载共享库的过程。

4. 系统范围的配置：
   由于 ld.so.conf 位于 /etc 目录下，它的配置对整个系统有效。这意味着所有用户和程序都会受到这个配置文件的影响。

因此，通过在 ld.so.conf 中添加新的库文件目录路径，就可以告诉动态链接器在哪里查找新安装的共享库，从而使得程序在运行时能正确地找到并链接所依赖的库文件。