美文网首页
用pymol绘制蛋白三维结构图

用pymol绘制蛋白三维结构图

作者: 爱吃海椒的妹妹 | 来源:发表于2023-01-24 07:02 被阅读0次
color wheat,obj01&name C* 设置小分子碳原子颜色
color smudge,!obj01&name C* 设置除小分子外的蛋白碳原子颜色

setting-cortoon-fancy helices 设置cortoon多一种样式

ray
png focus.png,16.93cm,16.93cm,dpi=600

save session为focus.fse
setting-transparency-cortoon-off 使之前变透明的蛋白恢复成不透明的状态

ray
png overview.png,16.93cm,16.93cm,dpi=600

可以调整使蛋白充满视野
平移,按住鼠标中键不放,然后上下左右移动,进行体会,蛋白会随着鼠标而移动
旋转,按住鼠标左键不放,然后上下左右移动鼠标,蛋白会进行旋转
缩放,按住鼠标右键不放,然后上下移动,蛋白会进行缩放
切割 滚动鼠标中键, 建议将蛋白渲染成surface模式,然后滚动鼠标中键

save session为overview.fse

保存


570273471562889986.jpg

本文参考两篇文章
高质量PyMOL作图教程_weixin_44887662的博客-CSDN博客_pymol作图
【软件使用】PyMol入门教程 - 简书 (jianshu.com)
以及B站视频
分子对接 三维可视化软件 PyMOL 操作简介

相关文章

网友评论

      本文标题:用pymol绘制蛋白三维结构图

      本文链接:https://www.haomeiwen.com/subject/gguoirtx.html