今天继续学习R,不得不说周末或许是一周中最忙的时候，难得的约约约都无可安置得集中在众所周知的空闲里，昨天偷懒看到选修就跳过了，Day 6 好好做下笔记，不辜负豆花辛苦的教程。

1. 获取 R cheatsheet 的方法

• 百度/谷歌 XX小抄
• Rstudio 的 cheatsheet 网站
  https://www.rstudio.com/resources/cheatsheets/
• 生信星球 微信公众号

2. 了解数据框

通过这段命令学习一下数据框的构建以及相关函数

a<-data.frame(GeneId=rep("gene5",times=3),SampleName=paste("sample",1:3,sep=""),Expression=c(14,19,18))

• data.frame(colname1,colname2,colname3,...)
  -- 通过“=“给3个列名赋值GeneId,SampleName,Expression(如果列名是数字要加引号，eg:"1999")
  -- 构建了一个包含三个向量的数据框

• rep(“x”,y)
  -- x-要重复的字符；
  -- y-重复次数

• paste("x",y,sep="")连结两个字符串
  -- x-字符
  -- y-字符（这里 用了数字）
  -- sep-指定分隔符

3. 了解 tidyr

3.1 主要功能

• 数据框的变形
• 处理数据框中的空值
• 根据一个表格衍生出其他表格
• 实现行或列的分割和合并

4. 下载和安装 tydir

• 查看是否已经安装：library(tidyr）
• 下载和安装：控制台中输入：install.packages("tidyr")
• 使用时需要在console中通过命令library(tidyr)载入
  我的电脑在安装软件时很给力啊，不仅没有报错，速度也很快～

5.了解Tidy Data

定义：是一种组织表格数据的方式，提供了一种能够跨包使用的“统一”的数据格式（实质上变成非常整齐的三列：variable-case-observation）。

6. tydir 的应用

6.1 Reshape Data

引自 生信星球

定义一个数据框a，然后通过gather将它统一格式：

a<-data.frame(country=c("a","b","c"),"1999"=paste(c(0.7,37,212),"k"),"2000"=paste(c(2,80,213),"k"))

gather(a,X1999,X2000,key="year",value="cases")
gather(a,"year","cases",X1999,X2000)#花花教的优秀偷懒做法
gather(a,year,cases,-country)#花花教的高效做法（整合除country以外的列）

key键-统一格式的第二列
value值-统一格式的数值列（别忘记 给他一个列名哦）

6.2 Handle Missing Values

引自 生信星球

• read.csv()#花花总结的 小妙招(将已有数据赋值给x导入到Rstudio处理)
  在R和Excel中通用，默认参数很好用，不像read.table()乱码频出
  导入：x<-read.csv("a.txt")
  导出：x<-read.csv(X,"a.txt")
• 有些应付的三个函数
  --drop_na()
  -- fill()
  -- replace_na()

6.3 Expand Tables

引自 生信星球

• complete(data,...,fill=list(colname="#要补充的内容（“字符串”or 数字）"))
• expand(data,...)：列出每列值所有可能的组合

6.4 Split Cells

引自 生信星球
引自 生信星球

• separate:按列分割
• separate_rows:按行分割
• unite:分割完了再合并回去