问题：已知一个核酸序列为seq = "AATTGC" 利用python程序计算各个碱基出现的频率。
# 如何计算核酸序列中碱基出现的频率
seq = "AATTTGC"
base = {}
for nucl in range(len(seq)):
if seq[nucl] in base:
base[seq[nucl]] += 1
else:
base[seq[nucl]] = 1
for each in sorted(base.keys()):
print(each + " " + str(base[each]))
# 输出列表格式
print(sorted(base.items(), key=lambda x: x[1]))
输出结果
方法2： 利用count函数，统计ATCG四种碱基的出现次数。
seq = "AATTTGC"
for nucl in 'ATCG':
num = seq.count(nucl)
print(nucl, num)
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本文标题：7. 利用python计算核酸序列中各碱基的次数
本文链接：https://www.haomeiwen.com/subject/gkumkhtx.html
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