宏基因组分析理论教程
微生物组入门圣经+宏基因组分析实操课程
1背景知识-Shell入门与本地blast实战
2数据质控fastqc, Trimmomatic, MultiQC, khmer
3组装拼接MEGAHIT和评估quast
4基因注释Prokka
5基于Kmer比较数据集sourmash
6不比对快速估计基因丰度Salmon
7bwa序列比对, samtools查看, bedtools丰度统计
8分箱宏基因组binning, MaxBin, MetaBin, VizBin
9组装assembly和分箱bin结果可视化—Anvi’o
宏基因组实战10. 绘制圈图-Circos安装与使用
MetaPhlAn2分析有参宏基因组
前言 宏组学（Meta-Omics）是涵盖宏基因组学、宏转录组学和宏蛋白质组学的一门学科。其中宏基因组研究可以获知...
许多人跟我交流，自己的宏基因组和宏转录组要不要拼接？然后拼接要不要混这拼？对于这些问题，其实我没有很多的实战经验跟...
python 实战 - 根据已知蛋白名称从基因组提取蛋白序列
Microbiome：宏基因组分箱流程MetaWRAP简介 MetaWRAP分箱流程实战和结果解读
一次简化基因组数据分析实战 尽管目前已经有大量物种基因组释放出来，但还是存在许多物种是没有参考基因组。使用基于酶切...
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宏组学基本策略 宏基因组 (Metagenomics)：是一种以环境样品中的微生物群体基因组为研究对象，以功能基...
主要内容： 1.16S rDNA测序 2.宏基因组测序 3.宏基因组的由来及发展过程 4.16S rDNA测序与宏...
导读 这是一篇来自Briefings in Bioinformatics 2018的综述。该综述比较了宏基因组宏转...
之前练习的图在这里，今天接着学习， GenVisR 基因组数据可视化实战 (一)[https://www.jian...
本文标题：宏基因组实战
本文链接：https://www.haomeiwen.com/subject/glyqectx.html
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