人体内生活着380万亿个病毒，其数量是细菌的十倍，它们几乎遍布人体各个角落，同样对人体的健康和微生态的平衡有重要影响。
中科院I区期刊FEMS Microbiology Reviews以《The role of virome in the gastrointestinal tract and beyond 》为题，对人体微生态研究的新热点——人体病毒组研究进展进行了综述报道。
人类肠道病毒组由多种共生病毒和致病性病毒组成。这些病毒在生命的初始就开始定殖，并通过母乳喂养等喂养形式和更广泛的环境暴露而进一步深化。在此过程中，病毒与宿主细菌之间不断互作，塑造了人体的菌群也塑造了人体。随着年龄的增长，肠道病毒组中真核病毒的丰富度增加，而噬菌体的丰富度及多样性下降。有趣的是，肠道病毒组的整体变化与肠道菌群呈现相反的趋势。
图1 健康个体一生中，人体肠道内细菌和病毒种群的变化
同时，饮食等因素对人体病毒组的影响也十分显著，部分饮食因素可以诱导噬菌体进而造成肠道微生物组的动态变化，影响肠道微生物组组成。受此影响，人体肠道病毒组也呈现出一定的种族或地域性。
已有研究报道，肠道病毒组与多种肠道疾病有关，包括一些急性感染和慢性疾病（详可参见原文Tabel 2 ）。病毒感染呈现出儿童与成人不同的易感差异，此外在不同类型的慢性疾病中，也明确了一些代表性病毒毒株。研究结果表明，肠道噬菌体一般不被认为是人类疾病的直接致病因子，而是调节细菌群落的主要驱动因素，造成生态失衡，进而诱发疾病症状。在此基础上，一些病毒亦可以作为生态失调相关疾病的生物标记物。
Tabel2 人类疾病中肠道病毒和细菌种群的改变
此外，病毒与免疫细胞间的相互作用触发了广泛的免疫反应，影响着人体的不同代谢途径。除了在调节人体肠道微生态方面的关键作用外，肠道病毒组还直接或间接地促进了远端器官的疾病发生。
图2 噬菌体与免疫系统之间的直接相互作用
图3 硫化氢（H2S）生产途径概述：人结肠细胞内的半胱氨酸分解代谢和硫酸盐还原细菌（SRB）中潜在的噬菌体AMG介导的硫酸盐还原及其对人类健康的影响
现有对人体肠道病毒组的研究仍十分有限，尤其是对噬菌体的研究仍有很大的空白：大多数噬菌体基因组与现有的病毒数据库没有同源性，且不能与宿主进行关联，同时，受限于技术，难以对肠道病毒组组成进行评估，都阻碍了人体病毒组相关研究的开展。
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