###肿瘤样本提取
Idents(seurat_obj) <- "orig.ident" ##Idents函数定义要取的类别
sub_tumor<- subset(seurat_obj,idents=c("sample1a","sample1b","sample2b","sample3a","sample3b","sample4at"), do.clean=T)
###肿瘤样本提取
Idents(seurat_obj) <- "orig.ident" ##Idents函数定义要取的类别
sub_tumor<- subset(seurat_obj,idents=c("sample1a","sample1b","sample2b","sample3a","sample3b","sample4at"), do.clean=T)
###肿瘤样本提取 Idents(seurat_obj) <- "orig.ident" ##Idents函数定...
单细胞空间转录组和单细胞分析类似，不可避免的会遇到多样本的问题，这就需要使用多样本整合分析策略Seurat提供了多...
上期我们讲了使用Seurat分析单个样本，那么2个或多个样本的分析会有哪些不同呢？单细胞转录组数据中一个重要的问题...
1、多样本读取与创建对象 参考:Seurat包之导入单细胞数据方式汇总[https://www.jianshu.c...
单细胞前期工作重要的是如何将测序得到的多样本整合同步分析： library(Seurat) folders=lis...
适用于多个样本合并分群之后想要再次修改样本名称
单细胞测序分析预处理结束，拿到原始count或者TPM文件后，我们到了下游分析处理环节。 Seurat包是单细胞入...
由于Immujent最近比较忙，单细胞流程的教程就搁置了一段时间，今天小编继续拾起之前的剩下的内容来介绍一下Seu...
看了很多教程，下面这两个个复现出来了。 1、Seurat包合并多个单细胞样本[https://www.jiansh...
项目场景： 使用scanpy包进行单细胞数据分析时，往往需要整合多个样本的数据，也就是将多个AnnData对象合并...
本文标题：单细胞多样本混合Seurat对象取部分样本下游分析
本文链接：https://www.haomeiwen.com/subject/gzhvjktx.html
网友评论