2023-08-25plink使用问题：维持原有ref和alt位

在plink用默认参数进行数据过滤和分析时，有时会更改一些snp的ref和alt位置，好像是自动把优势等位定义为ref？

这个诡异的操作，会影响分析结果，及优势等位分析，及连锁分析。有一个参数--keep-allele-order可以维持原来形态不变。