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2020-11-26单细胞测序上游实践一

2020-11-26单细胞测序上游实践一

作者: curleyc | 来源:发表于2020-11-26 19:38 被阅读0次

主要是学习上游实践过程中比较

添加路径一定要完整(服务器上面添加配置解压好的cellranger的环境)

$ export PATH=/opt/cellranger-2.2.0:$PATH

结果分析 https://www.jianshu.com/p/e8b2b9a43cb3

质控之后结果解读https://www.bioinformatics.babraham.ac.uk/projects/fastqc/Help/3%20Analysis%20Modules/

https://www.cnblogs.com/jxlab-guorong/p/10248924.html很好

cellranger使用方法https://www.jianshu.com/p/5157ab9f6977

这个写的很好使用cellranger count:https://www.jianshu.com/p/08f75901cc3e

之后会来补充

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