1、在线网址
Matascape (https://metascape.org/gp/index.html#/main/step1)
WEB-based GEne SeT AnaLysis Toolkit (https://www.webgestalt.org/)
2、生信工具
clusterProfiler
Matascape (https://metascape.org/gp/index.html#/main/step1)
WEB-based GEne SeT AnaLysis Toolkit (https://www.webgestalt.org/)
clusterProfiler
1） Why GSEA？ 传统KEGG（通路富集分析）和GO（功能富集）分析时，如果富集到的同一通路下，既有上调差...
做完通路富集分析，拿到几十条富集通路后，我们经常会寻找与“某关键词”相关的通路。例如与癌症相关的通路，与免疫相关的...
1 GO和KEGG富集分析工具：Clusterprofiler包和REVIGO 进行基因功能或生物学通路富集的工具...
功能富集分析方法 clusterProfiler 支持多种本体论/通路 (ontology/pathway) 的超...
Following tutorial from 2019 Nature Protocol (https://www...
转录组分析传送门 NGS手把手教学之零基础RNA-seq转录组分析实践，两套方案(2022年最新）[https:/...
什么是富集分析？ 粗糙的理解：知道这个基因在什么通路中，执行什么样的功能。 根据差异基因做富集分析 采用超几何检验...
功能(GO)或者通路(Pathway)富集分析时，都会涉及到 Background; 做分析时，分析工具会提供一些...
使用R语言clusterProfiler包进行KEGG富集分析（有参分析） 我们在前面的视频教程中，为大家讲述了G...
之前我们介绍了一项整合多维组学通路分析的工作ActivePathways，能够在多个数据集中识别到显著富集的通路，...
本文标题：通路富集分析
本文链接：https://www.haomeiwen.com/subject/heyyedtx.html
网友评论