2019-11-14 生信学习DAY 0

【生信技能树】生信人应该这样学linux
P1 linux-0-生信入门环境
P2 linux-1-学习资源介绍
P3 linux-2-系统认知

1. 必备软件【windows版】

xshell or PuTTY #连接服务器，命令行终端
winscp or Xmanager or Filezillas #连接服务器，文件传输
finalshell #连接服务器
git #代码仓库
幕布 #笔记
Typora #markdown写作
notepad++ #编写代码，查看数据文件

2. R语言编译环境配置

   2.1 R及Rstudio下载地址

   R【www.r-project.org】
   RStudio【www.rstudio.com】

   2.2 Rstudio界面

   
   Rstudio界面

   2.3 R包

   2.4 命令记录

getwd()  #获得当前目录位置
dir.create()  #建立目录
installed.packages()  #查看已经安装的包
dim(installed.packages()))  #统计已安装包的个数
install.packges('XXX')  #安装'XXX'包
.libPaths()  #查看R包安装位置
library(XXX)  #加载'XXX'包

3. Linux学习资源介绍&系统认知
   命令记录

ls  #查看目录下的内容
touch  #创建新的文件
cd+空格+目录名 #进入下一级目录
cd ..  #返回上一级目录
history  #显示历史命令
ssh+空格+用户名@ip地址  #远程登录服务器
su  #切换用户
sudo  #获取权限
sudo adduser  #增加用户
w  #显示目前登录系统的用户信息
passwd+空格+用户名  #更改密码