李恒课题组最新出品的srf用于鉴定基因组中的卫星DNA.
预发表地址： https://doi.org/10.48550/arXiv.2304.09729
github地址：https://github.com/lh3/srf
卫星DNA概念:
卫星DNA是由非常大的串联重复非编码DNA组成。卫星DNA主要存在与端粒和着丝粒上。卫星DNA长度是几到几千个碱基。
SRF是一种不需要任何已有的数据库，从头预测鉴定卫星DNA的工具。目前基因组T2T组装，特别需要这种辅助组装端粒和着丝粒的工具。SRF文中称职为 high-order repeats（HORs）
SRF使用的场景
SRF可以用于二代测序、三代测序、组装的contigs.就是长短读长数据都可以。
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本文标题：基因组中卫星DNA鉴定工具：srf
本文链接：https://www.haomeiwen.com/subject/hzxijdtx.html
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