名词

• 保守性：跨物种保存，如一个gene在猩猩中存在，在人类中也存在
• 转录本：由一条基因通过转录形成的一种或多种可供编码蛋白质的成熟的mRNA。
• 共表达：eg: 一个基因在2、4、6、8小时内表达值连续升高或降低，而另一个基因跟着他也连续的升高或者降低，那么这种情况就称为共表达，他们之间可以是正相关或者负相关。即，两个或多个基因同时表达，就是基因共表达。可以通过斯皮尔曼，皮尔森相关系数计算。
• ATAC-Seq与ChIP-Seq的异同
  ATAC-Seq与ChIP-Seq的不同的是ATAC-Seq是全基因组范围内检测染色质的开放程度，可以得到全基因组范围内的蛋白质可能结合的位点信息，一般用于不知道特定的转录因子，用此方法与其他方法结合筛查感兴趣的特定调控因子；但是ChIP-Seq是明确知道感兴趣的转录因子是什么，根据感兴趣的转录因子设计抗体去做ChIP实验拉DNA，验证感兴趣的转录因子是否与DNA存在相互作用。ATAC-Seq、ChIP-Seq、Dnase-Seq、MNase-Seq、FAIRE-Seq整体的分析思路一致，找到富集区域，对富集区域进行功能分析。

作者：六六_ryx
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