linux 安装R包，报错ggforce.rdb is cor

在linux 服务器上安装R  分析包，总会遇见很多错误！在windows下安装通常会比较顺利！总结了一套通过window 安装linux R 分析包的经验，共享给大家。

比如安装R 的 clusterProfiler 分析包，使用命令BiocManager::install("clusterProfiler"）报错信息如下：

ERROR: compilation failed for package ‘systemfonts’

ERROR: dependency ‘systemfonts’ is not available for package ‘ggforce’

ERROR: dependency ‘ggforce’ is not available for package ‘ggraph’

ERROR: dependency ‘ggforce’ is not available for package ‘scatterpie’

ERROR: dependencies ‘ggraph’, ‘scatterpie’ are not available for package ‘enrichplot’

可以在window安装同一版本的R软件，安装好clusterProfiler后，找到包的安装路径，把依赖的包直接拷贝到linux lib目录下：

举例：

window:D:/software/R-4.2.0/library

拷贝到linux 服务器：/usr/anaconda/envs/R.4.2.0/lib/R/library

进入linux 服务器：

library（clusterProfiler）

如果报错,可以单独安装缺少或者损坏的包

如我遇到的错误：

shared object ‘ggraph.so’ not found

解决方法：

BiocManager::install("ggraph",force=TRUE)

ggforce.rdb is corrupt

解决方法：

重启R

再进入就可以了