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R语言学习丨绘图函数基础知识,pie()、barplot()从零

R语言学习丨绘图函数基础知识,pie()、barplot()从零

作者: 生信分析笔记 | 来源:发表于2022-09-23 22:40 被阅读0次

    今天笔记的内容是R语言中绘图相关的基础知识,绘制简单的饼图、条形图

    饼图怎么画?

    R语言中pie()函数用于绘制饼状图,需要准备向量数据、标签、调色板等信息,然后利用函数生成图片,语法格式为:

    pie(
    x,  #数值向量,饼状图中每块面积大小
    labels = names(x), #字符向量,各扇区的名称
    edges = 200, #外边圆圈的边数,越大越平滑
    radius = 0.8, #饼图半径
    clockwise = FALSE,  #逻辑值,是否对各块按顺时针进行分隔
    density = NULL, #底纹密度
    angle = 45, #底纹斜率
    col = NULL,  #每个区域的颜色
    main = NULL,  #标题
    …)
    

    接下来进行示例演示,我们做一个简单的饼图。

    #安装与加载R包
    install.packages("plotrix", repos = "https://mirrors.ustc.edu.cn/CRAN/")
    library(plotrix)  #plotrix用于绘制3d饼图
    #输入变量
    x = c(1, 2, 4, 8)
    #输入标签名称
    ns = c("a", "b", "c", "d")
    #输入调色信息
    cols = c("#ED1C24","#22B14C","#FFC90E","#3f48CC")
    #绘制3D饼图
    pie3D(x,labels = ns,explode = 0.1, main = "first pie plot")
    #绘制平面饼图
    pie(x,labels = ns,col=cols)
    

    然后可以在右下角plot窗口看到如下饼图:


    3D饼图
    平面饼图
    可以使用png()jpeg()bmp() 函数设置输出的文件格式为图片,如下:
    #设置文件名称和参数
    png(filename = "first-pie.png",height = 400,width = 400)
    #绘制图形
    pie(x,labels = ns,col=cols)
    #关闭打印器(相当于把图片保存,只有这样才能打开这个图片,不然是0B,因为系统默认处于一直编辑状态)
    dev.off()
    

    条形图怎么画?

    R语言中用 barplot() 函数来创建条形图,格式如下:

    barplot(
    height, #条形图的高度
    width, #条的宽度
    sapace #条之间的间隙值
    horize #是否水平放置
    xlab, #x轴标签
    ylab, #y轴标签
    main, #标题
    names.arg, #每个矩形条的名称
    col, #颜色
    )
    

    接下来进行示例展示,绘制两个条形图,前者是常见的一维向量条形图,后者是二维向量制作的堆叠条形图。

    a <- c(1,2,3,4,3,2,1)
    names(a) <- c('a','b','c','d','e','f','g')
    png(filename = "secendplot.png")
    #绘制条形图
    barplot(a,main = "two barplot",legend=FALSE)
    dev.off()
    #工作目录下会有一个图片文件生成,打开可以查看结果。
    

    接来下用矩阵来试试,3×3的矩阵绘制出来有两部分堆叠在一起。

    b <- matrix(c(1,2,3,4,2,3,1,4,1),nrow = 3,byrow = T)
    colnames(b) <- c('c1','c2','c3')
    rownames(b) <- c('r1','r2','r3')
    barplot(b,main = "3 barplot",legend=FALSE)
    #完成后在屏幕右下角plot窗口查看图片,也可以进行保存。
    

    beside 参数

    • beside=FALSE 时,条形图的高度是矩阵的数值,矩形条是水平堆叠的。

    • beside=TRUE 时,条形图的高度是矩阵的数值,矩形条是并列的。

    比如,用刚刚矩阵的数据绘制时,添加一个参数beside=TRUE,得到下列结果。

    barplot(b,main = "4 barplot",legend=FALSE,beside = TRUE)
    

    补充内容:有时候安装R包出现报错,安装失败。可以试试通过下面这种方式来安装,只需要复制代码,然后把想安装的包名称写进去就可以。

    if (!require("BiocManager", quietly = TRUE))
      install.packages("BiocManager")
    BiocManager::install("这里填写需要安装的R包")
    

    参考资料:https://www.runoob.com/r

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