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使用Anaconda安装Biopython库

使用Anaconda安装Biopython库

作者: 雨林课堂 | 来源:发表于2021-05-27 11:49 被阅读0次

1. 查看目前python的安装库;

1.1# conda list 

1.2# pip list

1.3 # 使用电脑Anaconda的安装位置查看: C:\anaconda2022\Lib\site-packages

pip和Anaconda的差别:两个都是是两个独立的包管理器:Conda是适用于任何语言的软件包、依赖项和环境管理系统--包括Python,R,Ruby,Lua,Scala,Java,JavaScript,C / C ++,FORTRAN等

conda是一个通用的包管理器,意思是什么语言的包都可以用其进行管理,自然也就包括Python了。在安装Anaconda或者Miniconda时,会对conda进行一同安装。其中Anaconda作为Python的发行版,相当于在Python的基础上自带了常用第三方库,而Miniconda则相当于是一个conda环境的安装程序,只包含了conda及其依赖项,这样就可以减少一些不需要的第三方库的安装,所以Miniconda所占用的空间很小。

Pip同conda一样,也是一个包管理器,并且是Python官方认可的包管理器。其中pip的含义是Pip Installs Packages。最常用于安装在Python包索引(PyPI, Python Package Index https://pypi.python.org/pypi)上发布的包。因此,在通过conda list命令查看当前环境下已安装的包时,通过pip的源是pypi。

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版权声明:本文为CSDN博主「敲代码的quant」的原创文章,遵循CC 4.0 BY-SA版权协议,转载请附上原文出处链接及本声明。

原文链接:https://blog.csdn.net/FrankieHello/article/details/106083428

启动Anaconda步骤

注意:之后在Jupyter Notebook的所有操作,都请保持终端不要关闭,因为一旦关闭终端,就会断开与本地服务器的链接,你将无法在Jupyter Notebook中进行其他操作。

3. 查看当前python安装位置、安装版本

#where python

#python--version

3. 安装biopython (失败)

# conda install -c conda-forge biopython 

失败,无法使用biopython。原因是未使用Bash中启动Jupyter notebook导致无法加载Biopython库,需要在指定文件夹中使用Bash启动jupter notebook)

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