学习小组Day7-沈荣

1.镜像设置

file.edit('~/.Rprofile')
options("repos" = c(CRAN="[https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/](https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/)")) #对应清华源
options(BioC_mirror="https://mirrors.ustc.edu.cn/bioc/") #对应中科大源

再运行

options()$repos和options()$BioC_mirror

即可

2.R包的安装与加载

①安装（联网）

install.packages(“包”)

BiocManager::install(“包”)

②加载

library(包)；require(包)

3.dplyr五个基本函数

安装并加载dplyr

mutate(),新增列

新增列

select(),按列筛选

①按列号筛选:select(变量名,列号)，如select(test,1)

②按列名筛选:select(变量名,列名)，如select(test, Petal.Length, Petal.Width)

按列筛选

one_of()函数：用来选择声明变量，即选择vars为变量。

③filter()筛选行：filter(变量名,所要筛选的行)，如filter(test, Species == "setosa")；filter(test, Species %in% c("setosa","versicolor"))

筛选行

④arrange(),按某1列或某几列对整个表格进行排序：

arrange(变量名,要排序的列名)，如arrange(test, Sepal.Length)，默认由小到大排序；arrange(test, desc(Sepal.Length))，这里用desc表示从大到小排序

排序

⑤summarise()：汇总

summarise(变量名,要汇总的方式)，如summarise(test, mean(Sepal.Length), sd(Sepal.Length))，mean:求平均值，sd：求标准差

group_by()：分组

group_by(变量名，分组的列名)，如group_by(test, Species)

分组再汇总：如summarise(group_by(test, Species),mean(Sepal.Length), sd(Sepal.Length)

汇总

4.dplyr两个实用技能

①%>% (cmd/ctr + shift + M)：管道操作

管道传参，即将左边的值传递给下一个函数

管道传参

②count()统计某列的unique值

count(变量名,列名)，如count(test,Species)

计算unique值

5.dplyr处理关系数据：连接两个表格

data.frame()函数建立表格

內连inner_join,取交集

内连

左连left_join

左连

右连right_join

右连

全连full_join

全连

半连接：返回能够与y表匹配的x表所有记录semi_join，即返回重叠部分

半连接

反连接：返回无法与y表匹配的x表的所记录anti_join，即返回不重叠部分

反连接

简单合并

bind_rows()：需要两个数据框列数相同

bind_cols()：需要两个数据框行数相同

简单合并

否则：

5.思维导图

今天的合并数据稍微有些难理解，尚可尚可