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思路清奇SCI:05.ssGSEA+41条代谢通路

思路清奇SCI:05.ssGSEA+41条代谢通路

作者: 高大石头 | 来源:发表于2021-04-29 17:34 被阅读0次

    PMID: 33324566

    路线图

    结果

    1.ssGSEA分析代谢通路+PAM聚类

    作者从MSigDB和KEGG收集了41条代谢相关通路,ssGSEA计算各个样本的评分,对ssGSEA用PAM方法聚类。


    Fig 2

    2.聚类结果周边

    Fig 3
    Fig 4
    Fig 5

    3.WGCNA确定核心基因

    Fig 6

    4.模型构建

    Fig 7

    5.药物敏感性+免疫反应

    Fig 9

    备注:

    1. 前列腺癌总体生存期较好,目前主要预测的是无复发生存期(disease-free survival,DFS)

      2.肿瘤不只有预后分析,诊断的作用同样重要。

      参考文献:
      Identification of Metabolism-Associated Prostate Cancer Subtypes and Construction of a Prognostic Risk Model

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