一、显示 .settings 目录

首先切换到Java项目的界面，然后选中项目，点击倒三角图标。

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然后选择Filters，将.*resources、Empty library containers的勾选去掉即可。
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二、目录中相关文件说明

相关文件的说明请参考

http://www.cnblogs.com/shihaiming/p/5803957.html
http://www.cnblogs.com/skillking/p/6653692.html

这里要说的是解决一些问题，如

Cannot change version of project facet Dynamic Web Module to 3.1

就是我们在创建web项目的时候，使用的web容器版本过低，这里我将其换成3.1版本，就出现了这个问题。

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从这里可以看到dynamic web module版本为2.3。

解决方式参考http://blog.csdn.net/steveguoshao/article/details/38414145
首先将web.xml中的web容器版本换成3.1

<?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?>
<web-app xmlns:xsi="http://www.w3.org/2001/XMLSchema-instance"
    xmlns="http://xmlns.jcp.org/xml/ns/javaee"
    xsi:schemaLocation="http://xmlns.jcp.org/xml/ns/javaee http://xmlns.jcp.org/xml/ns/javaee/web-app_3_1.xsd"
    id="WebApp_ID" version="3.1">

</web-app>

修改org.eclipse.wst.common.component

<?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?><project-modules id="moduleCoreId" project-version="1.6.0">

这里将project-version="1.6.0"

修改org.eclipse.wst.common.project.facet.core.xml，未修改时是这样的

<?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?>
<faceted-project>
  <fixed facet="wst.jsdt.web"/>
  <installed facet="jst.web" version="2.3"/>
  <installed facet="wst.jsdt.web" version="1.0"/>
  <installed facet="java" version="1.8"/>
</faceted-project>

修改之后为：

<?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?>
<faceted-project>
  <fixed facet="wst.jsdt.web"/>
  <installed facet="jst.web" version="3.1"/>
  <installed facet="wst.jsdt.web" version="1.0"/>
  <installed facet="java" version="1.8"/>
</faceted-project>

之后再次选中项目右键，选择properties查看，可以看到已经改为3.1了：

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