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2020-03-05 “nf-core”组学分析工具荟萃网站

2020-03-05 “nf-core”组学分析工具荟萃网站

作者: iColors | 来源:发表于2020-03-05 11:22 被阅读0次

    生信分析工具五花八门,不同的工具得到分析结果常大相径庭。nf-core为此而生,解决分析流程的标准化、可移植、可重复的问题。汇聚了39个高质量的分析流程,主要的是基因组学,还有部分蛋白质组学分析流程。

    网站https://nf-co.re
    代码https://github.com/nf-core
    文章https://www.nature.com/articles/s41587-020-0439-x

    工具列表

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    举几个例子,大家慢慢学习。

    名称 网站 用途
    scrnaseq https://nf-co.re/scrnaseq 单细胞RNAseq
    atacseq https://nf-co.re/atacseq ATAC-seq
    chipseq https://nf-co.re/chipseq ChIP-seq
    mhcquant https://nf-co.re/mhcquant 质谱数据定量
    proteomicslfq https://nf-co.re/proteomicslfq 蛋白质组无标定量数据
    ddamsproteomics https://nf-co.re/ddamsproteomics 蛋白质组DDA数据
    diaproteomics https://nf-co.re/diaproteomics 蛋白质组DIA数据
    imcyto https://nf-co.re/imcyto 质谱流式图像分析

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