简化基因组
R ggplot2
library(ggplot2)
a<-read.table('trait1.glm.stat',header = T)
a1<-subset(a,select=c(Trait,Pos,p))
a2<-data.frame(a1,log10(a1[,3]))
names(a2)=c("Trait","Pos","p","LOD")
ggplot(a2,aes(Pos,LOD,fill=Trait,col=Trait))+geom_point(size = 1.0)
a2的数据结构：
图片.png
结果：
图片.png
简化基因组R ggplot2 a2的数据结构： 结果：
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本文标题：关联分析绘图
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