细菌感染： 排除掉带“病毒”的名字
合并细菌和不合并细菌感染的VTE和PE的发生率 PE_yingxiang HVTE的发生率
合并细菌感染的人群的菌类分布——菌谱
不同菌类感染 的VTE和PE的发生率
一个患者共感染的细菌数量，不同数量的VTE和PE的发生率
感染途径是医院获得和社区获得，感染时间-入院时间<48小时
霉菌和细菌的分类（待做）
混杂因素分析（待做）
多重耐药菌（待做）
敏感、耐药的分布待讨论

0 细菌感染： 排除掉带“病毒”的名字

table(bi_vte$bacterial_infection)

0 1
3096 1342
感染率：0.3023885

1 合并细菌和不合并细菌感染的VTE、PE的发生率

合并细菌和不合并细菌感染的VTE的发生率

table(bi_vteHVTE)

   0    1

0 2970 95
1 1222 99
合并细菌VTE 0.07494322
不合并细菌感染的VTE 0.03099511

合并细菌和不合并细菌感染的PE的发生率

table(bi_vtePE_yingxiang)

   0    1

0 3038 27
1 1303 18
合并细菌PE 0.01362604
不合并细菌感染的PE 0.008809135

2 合并细菌感染的人群的菌类分布——菌谱

bi_freq.csv

bi_freq_new.csv

3 不同菌类感染 的VTE和PE的发生率

白念珠菌

bnz <-bi_vte[grepl("白念珠菌",bi_vteHVTE)
0 1
586 46
0.07278481

铜绿假单胞菌 234

0.1077586

鲍曼不动杆菌 199

0.1060606

烟曲霉 162

0.08024691

肺炎克雷伯菌 157

0.0516129

光滑念珠菌 130

0.1129032

热带念珠菌 99

0.05050505

纹带棒杆菌 96

0.07291667

念珠菌属 78

0.07692308

黄曲霉 77

0.1060606

4 一个患者共感染的细菌数量 ，不同数量的VTE和PE的发生

0    1    2    3    4    5    6    7    8    9

0 3096 0 0 0 0 0 0 0 0 0
1 0 711 321 163 73 46 18 7 2 1

bi_count_VTE

bi_count_PE

5 感染途径是医院获得 H_BI 和社区获得 C_BI，感染时间-入院时间<48小时

table(bi_VTE_newHVTE)

          0    1
       2764   90

C_BI 1186 74
H_BI 242 30
table(bi_VTE_newPE_yingxiang)

          0    1
       2828   26

C_BI 1245 15
H_BI 268 4

6 霉菌和细菌的分类（待做）

7 混杂因素分析（待做）

8 多重耐药菌（待做）

9 敏感、耐药的分布待讨论