cat test.fasta|awk '/^>/&&NR>1{print "";}{ printf "%s",/^>/ ? $0" ":$0 }'|awk '{print $1"\t"length($NF)}'
计算FASTA文件中每条序列的长度输入文件fasta.txt 脚本如下,脚本名:get_fasta.pl 运行脚本...
Fasta序列长度的计算的原理就是将不同染色体长度存入哈希,最后用length去计算哈希元素(字符串)的长度。 p...
计算FASTA文件中每条序列的长度输入文件fasta.txt 自己写脚本 网上其他答案 自己写的还是会有欠缺,没有...
参考: https://www.biostars.org/p/127141/快速计算fasta序列长度的方法 Ti...
Part1 :计算fasta的序列的长度建立一个测试文件 注意点:line.rstrip() 去掉换行吧符,因为不...
在处理fasta序列的时候,我们经常需要获取每一条fasta序列的长度。今天小编就跟大家来分享四种获取fasta序...
使用Python对fasta格式的序列进行基本信息统计预期设计输出文件中包括fasta文件名,序列长度,GC含量以...
目的 如题 脚本 来源:https://blog.csdn.net/tangxc10/article/detail...
seqkit 安装 使用 结果展示
1.缩短fasta格式蛋白质id行的长度 perl -lne 'if(/>/){$_=~m/>Sol.*\.[0-...
本文标题:计算fasta长度
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