Ka/Ks分析与纯化选择negative purifying s

ω = dN/dS, the ratio of nonsynonymous/synonymous substitution rates
dN/dS就是Ka/Ks，非同义替换率/同义替换率

ω < 1 的区域：negative purifying selection （负向）纯化选择；非同义替换率小于同义替换率，此时大多数非同义替换是有害的，大部分非同义替换被purify。

ω = 1 的区域：neutral evolution 中性进化；非同义替换率等于同义替换率，核酸替换无关痛痒，不受到强烈选择，此时进化主要由遗传漂变主导；

ω > 1 的区域：positive selection 正选择；此区域发生的非同义替换对物种有利，并且受到环境的正选择保留了下来。

大多数情况（基因组区域）下 ω < 1 。