今天又是学习的一天,学习了用R自制服务器生信小程序,想想以前实习学了两周的perl,真是时光催人老。
其实想要把R脚本变成键入式的小程序也很简单,只需在R脚本下添加参数:
args <- commandArgs(TRUE)
####添加注释内容
if(length(args) !=2){
cat('usage:Rscript boxplot.R expr group, expr is expr matrix,group is group inf')
quit("sys error, pls reput")
}else{
expr=read.csv(args[1],header = T,row.names = 1)
group=read.csv(args[2],row.names = 1)
}
然后运行
Rscript R.R arg1 arg2
又画了一张图,对称云雨图
image.png做ppt有点久,加油
沾了团队的光
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