一、基本语法

1.标题

一个#是一级标题，二个#是二级标题，以此类推。

# 这是一级标题
## 这是二级标题
### 这是三级标题

2.字体格式

**这是加粗的文字**
*这是倾斜的文字*`
***这是斜体加粗的文字***
~~这是加删除线的文字~~

3.引用

>这是引用的内容

4.图片

![图片alt](图片地址 ''图片title'')
说明：
图片alt就是显示在图片下面的文字，相当于对图片内容的解释。
图片title是图片的标题，当鼠标移到图片上时显示的内容。title可加可不加

5.有序列表

语法：数字加点
1.列表内容
2.列表内容
3.列表内容

二、代码

1.单行代码

`代码内容`

2.多行代码

(```)
  代码...
  代码...
  代码...
(```)
注：前后三个反引号处加了小括号，为了防止转译，实际是没有的。

三、R-Markdown基本使用方法

1.JPG

参数的设定

1.代码块设置

• echo=FALSE 最终的文档中不会显示代码，只会显示代码运行的结果和图像
• results="hide" 隐藏结果，显示图像
• include=FALSE 隐藏代码和运行的输出（写报告时可使用include=FALSE来隐藏所有的代码，从而突出图像。）
• fig.show="hide" 隐藏图像
• 对于图像，可以通过fig.width和fig.height来设置宽和高，举例：

{r scatterplot, fig.width=8, fig.height=6}
plot(x,y)

• 使用include=FALSE隐藏所有的代码、结果和图像，同时使用include=TRUE和results="hide"则会隐藏结果显示图像
  eval=FALSE显示代码而不显示运行结果。

2.全局代码块设置

避免每次使用代码块都重复敲代码来设置代码块，可按如下设置初始代码块：

{r global_options, include=FALSE}
knitr::opts_chunk$set(fig.width=12, fig.height=8, fig.path='Figs/',
                      echo=FALSE, warning=FALSE, message=FALSE)

warning=FALSE 和message=FALSE最终文档中不会显示R软件任何的提示信息， fig.path='Figs/'把图片保存在Figs子文件夹中（默认情况下图片不会被保存，注意Figs后面的斜线“/”不可少，否则图片会以Figs为文件名开头被保存在主目录中）。
如果在某个特定代码块中需要不一样的设置，可以单独设置该代码块，如：

par(mfrow=c(8,2))
for(i in 1:16)
  plot(x[,i], y[,i])

在给合作者的报告中，可能会使用include=FALSE, echo=FALSE作为全局设置，生成图像时使用include=TRUE，这样可以只输出图像。

参考作者：

R Markdown 使用方法笔记 - huidan - 博客园 (cnblogs.com)
R-Markdown学习与使用 - 简书 (jianshu.com)
献给写作者的 Markdown 新手指南 - 简书 (jianshu.com)

致谢！