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circos 安装

circos 安装

作者: 啦啦啦啦_d95f | 来源:发表于2019-12-11 10:18 被阅读0次

绘制circos图,非root权限安装步骤:

1.下载circos包

wget http://circos.ca/distribution/circos-0.69-6.tgz

tar xzf circos-0.69-6.tgz

2.依赖的perl包检查

    检查本服务器运行circos相关的perl包是否已安装,否则运行circos 会报错

cd circos-0.69/bin

./circos -module

ok: 表示服务器中相应perl包已存在

missing: 表示服务器相应的perl包缺失,需要进行安装

2.相关perl包安装

最简单途径:

1.安装anaconda 

2.利用anaconda 安装perl

3.直接利用conda 安装相应的perl包(或者。。。。)

conda install -c bioconda perl-font-ttf

conda install -c bioconda perl-clone

conda install -c GD

3.(。。。。或者)用anaconda下的cpan(无root权限)安装相应的perl包

/mnt/ljh/SoftWare/anaconda2/bin/cpan 

install Set::IntSpan

install Math::Bezier

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