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circos 安装

circos 安装

作者: 啦啦啦啦_d95f | 来源:发表于2019-12-11 10:18 被阅读0次

    绘制circos图,非root权限安装步骤:

    1.下载circos包

    wget http://circos.ca/distribution/circos-0.69-6.tgz

    tar xzf circos-0.69-6.tgz

    2.依赖的perl包检查

        检查本服务器运行circos相关的perl包是否已安装,否则运行circos 会报错

    cd circos-0.69/bin

    ./circos -module

    ok: 表示服务器中相应perl包已存在

    missing: 表示服务器相应的perl包缺失,需要进行安装

    2.相关perl包安装

    最简单途径:

    1.安装anaconda 

    2.利用anaconda 安装perl

    3.直接利用conda 安装相应的perl包(或者。。。。)

    conda install -c bioconda perl-font-ttf

    conda install -c bioconda perl-clone

    conda install -c GD

    3.(。。。。或者)用anaconda下的cpan(无root权限)安装相应的perl包

    /mnt/ljh/SoftWare/anaconda2/bin/cpan 

    install Set::IntSpan

    install Math::Bezier

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