A项，为了便于公众即时知悉并合法运用，省级以上人民政府食品安全监督管理部门应当及时公布注册或者备案的特殊医学用途配方食品目录，并对注册或者备案中获知的企业商业秘密予以保密。A项表述正确。
B项，特殊医学用途配方食品应当经国务院食品安全监督管理部门注册。B项中提交A省食品安全监督管理部门注册是错误的。
C项，悦阳公司注册时，应当提交产品配方、生产工艺、标签、说明书以及表明产品安全性、营养充足性和特殊医学用途临床效果的材料。注册后应该严格按照注册的产品配方生产，擅自添加可能会造成不可预知的很严重的后果。未按照注册的产品配方、生产工艺等技术要求组织生产会被追究法律责任，C项中悦阳公司擅自添加益生菌是错误的。
D项，保健品的标签、说明书应声明“本品不能替代药品”，但RED粉剂是特殊医学配方食品，不需要声明这一点，D项错误。
综上，本题答案为A。
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