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你想干啥?让「TBtools」猜一猜

你想干啥?让「TBtools」猜一猜

作者: 生信石头 | 来源:发表于2022-01-13 16:34 被阅读0次

    写在前面

    今天是学校放假的第一天,原本我应该是在回家带娃的路上,但之前订票时没考虑到原来寒假已经到了,于是定的是周五晚上的票。Emmm,最近或者出差,或者赶赶项目,或者写写论文。尤其今天,工作状态一般,总之就是摸鱼的一天。
    看了看时间,也快晚上了,老铁说还是要推一个新稿子。想了下子,那就推之前已经出来的特性。

    应用场景

    很多时候,我们大概知道自己想干啥,比如用 TBtools 提取 Fasta 序列,或者用 TBtools 提取表格信息,或者用 TBtools 绘制热图等。于是我们手上往往会有输入文件,比如一个 Fasta 文件。那么正常的步骤是:

    1. 打开 TBtools
    2. 找到 TBtools Fasta 序列提取功能
    3. 点击进去
    4. 开始分析

    其中,尤其是第2步,在我们不断使用 TBtools 的过程中就会发现,高频的功能就那么多。于是我突然想到一个有趣的事情,让 TBtools 依据你的输入文件格式,自动判断你到底想干啥,然后给你几个候选功能,直接点击就行。

    具体使用

    (当然,你需要更新到 TBtools 最新版本),上述步骤简化为:

    1. 打开 TBtools
    2. 拖拽放置文件到 About Panel
    3. 在弹出的菜单中选择 Fasta Extract
    4. 开始分析

    换句话说,你都不用找菜单功能,TBtools 直接推荐给你了。

    数个实例

    如果你拖拽放置的是 Fasta 序列格式文件,那么可以 提取、统计、简化、预览等



    如果你拖拽放置的是 GFF3或者GTF文件,那么可以 提取、统计、基因结构可视化等



    如果你拖拽放置的是表格信息文件,如注释信息,那么可以提取,合并,追加等

    如果你拖拽放置的是数值矩阵,如基因表达量等,那么可以 PCA分析 或 绘制热图 等


    image.png

    写在最后

    Emmm,小小改进,更加便利。

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