写在前面 基因结构注释是基因组项目不可能躲开的一步。注释的策略很多,基于文本的naive注释应该是最古老但也有效的...
使用BRAKER2进行基因组注释 BRAKER2是一个基因组注释流程,能够组合GeneMark,AUGUSTUS和...
BRAKER2是一个基因组注释流程,能够组合GeneMark,AUGUSTUS和转录组数据。 在使用软件之前,有几...
使用augustus进行基因预测 重复序列屏蔽 结果 参考文献:
SnpEff使用方法 SnpEff 软件通过基因组结构注释数据(GTF文件),对VCF文件中的SNP/InDel信...
在基因组注释中,预测基因结构是最核心的一环,在众多的从头预测软件中,augustus应用较广。但是由于安装过程依赖...
Mikado是基于Python3写的基因组结构注释工具,它主要做的是从多个转录组组装工具得到的转录本里挑选出最好的...
准备训练集和测试集 根据Augutus的官方教程,可靠的基因结构序列的要求如下: 提供基因的编码部分,包含上游几K...
使用 �annovar对 SNP和 INDEL 进行功能注释,查看变异对基因结构和功能的影响。 ANNOVAR是一...
目的 基因功能的注释依赖于基因结构或者序列,将基因序列或蛋白序列和主流数据库进行比对获取该基因的功能信息,最终对预...
本文标题:生信 | 使用 augustus 进行基因结构注释 - 数据分
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