Chem3D快速查看分子轨道

• (1) 在ChemOffice菜单中找到 Chem3D, 紫色的图标.
• (2) 第一次打开时提示显示是用软件加速还是硬件加速. 随意吧, 默认好像是不用硬件加速.

• (3) 打开后界面如图:

  
  Chem3D界面
• (4) 界面主窗口的左边是分子3D显示, 右边是类似ChemDraw的分子绘制.

• (5) 我们以丁二烯为例, 在左边绘制一个丁二烯分子. 直接点击绘制部分, 左侧会出现绘制分子的工具栏, 绘制分子:

  
  绘制丁二烯
• (6) 我们可以在左侧3D显示处, 点击适当的工具条来调整视觉. 第一个是选择部分结构, 第二个是平移分子, 第三个是旋转分子, 第四个是放大缩小.
  视觉操作
• (7) 我们选第三个旋转, 鼠标左键按住, 拖拉鼠标, 调整视觉.
  调整视觉
• (8) 选择菜单的Surface -> Choose Surface -> Molecular Orbital (Huckel Calculation)
  分子轨道显示菜单
• (9) 此时会默认显示出HOMO轨道:
  丁二烯的Homo轨道
• (10) 在菜单中Surface ->Select Molecular Orbital, 可以显示各个分子轨道, 如图共有22个分子轨道, 其中11和12分别是HOMO和LUMO轨道, 其能级差是 (-4.076+14.636)eV. 我们选择LUMO看看
  选择不同分子轨道进行显示
  丁二烯的LUMO轨道
• (11) 在菜单Surface -> Display Mode, 有多种轨道表面的显示形式, 例如默认是Solid. 以下两种是Wire Mesh和Translucent的效果:
  Wire Mesh(上)和Translucent(下)效果

Enjoy ~