先准备数据（有差异表达基因和上下调关系）
将差异表达基因粘贴到STRING网站，一直点continue（如果前面还在转圈就不能点continue）
点击seting，并将独立的节点隐藏
可以看出有397个节点，并下载tsv文件（可以直接导入cytoscape的文件）
导入刚刚下载的tsv文件
点cytoscape中的style选项，选择自己喜欢的风格（没有放图）
需注意下图的选项会将所有之前做的改变都清零（更改过后，需谨慎点击）
然后将DEGs的表达情况（之前准备的包含上下调的csv文件）上传到cytoscape
上传的时候我将X1_1重新命名为expression，然后继续设置风格：
继续滑向下
导出
其实导出为PDF更方便以后修改
先准备数据（有差异表达基因和上下调关系） 将差异表达基因粘贴到STRING网站[https://string-db...
Cytoscape App Store https://apps.cytoscape.org/[https://a...
官方手册——上 Cytoscape3.7.2用户手册[http://manual.cytoscape.org/en...
官方手册——中 Cytoscape3.7.2用户手册[http://manual.cytoscape.org/en...
网络可视化软件Cytoscape，网络的现在版本是3.8.0（https://cytoscape.org/down...
首先，在https://cytoscape.org/网站下载cytoscape软件并安装好，注意本软件需要安装ja...
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本文标题：Cytoscape学习小结
本文链接：https://www.haomeiwen.com/subject/junlultx.html
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