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RIP-Seq(1)--实验原理及技术路线

RIP-Seq(1)--实验原理及技术路线

作者: Z_bioinfo | 来源:发表于2022-05-30 11:07 被阅读0次

    1.实验原理

    RIP-seq(RNA immunoprecipitation and deep sequencing)是RNA免疫沉淀与高通量测序结合的技术,它通过免疫沉淀目标蛋白来捕获蛋白体内结合的RNA。将捕获的RNA进行高通量测序,可获得RNA结合蛋白(RBP)在体内与众多RNA靶标的结合模式,并对其结合强度进行精确定量,最终通过分析目的蛋白在体内结合RNA的动态变化,阐述出目的蛋白对基因表达调控的分子机制。

    2.技术路线

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    RIP-Seq数据分析的原理与过程和ChIP-seq十分相似,所以这里略过前面的质控,简单说明比对和peak calling步骤

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