1.实验原理
RIP-seq(RNA immunoprecipitation and deep sequencing)是RNA免疫沉淀与高通量测序结合的技术,它通过免疫沉淀目标蛋白来捕获蛋白体内结合的RNA。将捕获的RNA进行高通量测序,可获得RNA结合蛋白(RBP)在体内与众多RNA靶标的结合模式,并对其结合强度进行精确定量,最终通过分析目的蛋白在体内结合RNA的动态变化,阐述出目的蛋白对基因表达调控的分子机制。
2.技术路线
image.png image.png image.pngRIP-Seq数据分析的原理与过程和ChIP-seq十分相似,所以这里略过前面的质控,简单说明比对和peak calling步骤
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