写在前面 这个包最终还是有人做了，前面的微生物中Wen Tao&Yong Xin Liu在Protein & Ce...[作者空间]
引言 大家好，我是小杜。 从2022年开始关注的同学知道，“小的生信筆記”面对的对象是针对零基础的同学，尤其是自学...[作者空间]
featureCounts是一个用来统计count数的软件，运行的速度飞快，比之前用的htseq-count快了好...[作者空间]
题目：对DEseq2差异分析得到的差异基因进行GO富集。 目的：旨在对基因和蛋白质功能进行限定和描述的。 内容：1...[作者空间]
题目：对筛选得到的差异基因做KEGG富集分析。 目的：富集分析给定的基因集对哪些功能的影响有针对性的，不是随机影响...[作者空间]
这里是佳奥！我们继续非模式种转录组的下游分析。 上篇我们拿到了raw count矩阵，但是我们还缺少很多东西，让我...[作者空间]
这里是佳奥！经历了一个学期，做了几遍转录组，感受颇深。 原理没变，方法没变，但是思维需要转变，我们需要时刻保持清醒...[作者空间]
学习内容 应用似然比检验 (LRT) 进行假设检验 将 LRT 生成的结果与使用 Wald 检验获得的结果进行比较...[作者空间]
学习目标 评估每次比较产生的差异表达基因的数量 从每次比较中构建包含重要基因的 R 对象 1. 汇总 为了汇总结果...[作者空间]
今天分享的学习笔记是一套转录组分析简单流程，适用于初学者入门阅读，从原始测序数据开始，经过质控、序列比对、定量表达...[作者空间]
学习目标 了解 DESeq2 涉及的不同步骤 了解变异的来源并检查 size factors 检查基因水平的离散估...[作者空间]
学习目标 了解如何在归一化过程中列出不同的 uninteresting factors(无关因素) 了解常用的归一...[作者空间]
学习目标 了解从 RNA 提取到获取基因表达矩阵， 既RNA-seq 分析的整个流程。 1. workflow 进...[作者空间]
7. 差异分析 将基因计数导入 R/RStudio 工作流程完成后，您现在可以使用基因计数表作为 DESeq2 的...[作者空间]
hisat2+stringtie 转录组[作者空间]
highly efficient assembler of RNA-Seq alignments into pot...[作者空间]
