安装R和R简介

R简介

R是一款广泛使用的免费的统计学软件。可用其交互界面进行一些统计分析，也可进行简单编程。

安装R

略，可自行百度

查看最新版本

网址如下：http://cran.r-project.org/
“R-X.X.X.tar.gz”表示最新版本是“X.X.X”，一般一个月更新一次。

在windows界面安装R

去镜像网站下载安装包即可，然后按照安装向导一步步操作,我推荐的是中科大源。

上图就是目前电脑在用的R版本的GUI。
另外强烈建议安装RStudio来运行R。其中社区版本是免费的。

在非Windows电脑中安装R（Macintosh或者Linux）

高手请自行学习。

安装R包

有些标准包在安装R的过程中就已经安装了。但有些附加包需要自己安装，以“rmeta”为例。
打开RStudio，在控制台输入下面代码即可：

install.packages("rmeta")
library(rmeta)

更多请自行搜索。

安装Bioconductor中的R包

代码如下，以“limma”为例：

source("http://bioconductor.org/biocLite.R")
biocLite("limma")
library("limma")

运行R

强烈建议在RStudio下运行R。
点这里

R简介

点这里
主要介绍R的数据类型。R中所有的变量都称为对象，如标量、向量、矩阵等等。赋值符号“<-”

x <-  2*3

向量（vector）是一维数组。
矩阵（matrix）是元素模式相同的二维数组。
数组（array）维数可以大于2。
数据框（dataframe）的元素不一定模式相同。
因子变量（factor）
列表（list）是一些对象的有序集合。

被忽视的热带疾病

被忽视的热带疾病指的是在热带国家严重危害人们但是研究相对较少的严重疾病。主要是一些寄生虫病或者感染性疾病。
本书的许多例子基于这些疾病。