作图是一直是科研工作的一项重大工程,可以说是一篇文章的门面担当!
好看的图表
不仅可以优雅地展示数据,阐述实验结果
可以迷惑同行评议,提升文章的档次
还可以获得同学的仰慕,提升交际能力
甚至可以赏心悦目,让你的多巴胺点亮科研灵感,早日登上诺奖领奖台。
在这个看脸的世界,无论是论文中的科研图表,还是给老师汇报的PPT,都得讲究颜值与才华兼顾。
比如下面这位朋友,由于作图太丑,欲语泪先流!
科研作图是如此的重要,趁手的兵器(作图工具)自然是需要好好挑选!
没有一件称手的兵器,俺老孙怎么好好玩耍呢~目前常见的科研作图软件有以下几种:
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OriginLab
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GraphPad Prism
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Python、R
这三种工具,都可以完成非常专业且好看的图,且1和3本人都在使用。
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Python和R画图需要编程,强大到只有想不到,没有做不到,也强大到没几个月的学习你根本啥都画不出来。
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OriginLab操作相对简单,但也有非常多的细节需要注意,而且我认为这个软件对于不同图表的画图逻辑并不统一,在做复杂的图或者多图拼接时,总体感觉不够灵活。爱真的需要勇气。
以上工具用的好,都非常强大,但较高的学习成本导致了较低的性价比。
所以,有没有那么一个软件,能像孙大圣的金箍棒一样,灵活而强大呢
Excel,
值得我们托付终身的画图利器!
EXCEL 科研绘图
我常常见一些同学,画柱状图, 一定要用OriginLab来画,结果一顿操作,也搞不出想要的效果。 别忘了,我们还有Excel!
EXCEL不是专门为科研作图而生,他的画图功能也并没有非常强悍,
但是EXCEL有着较低的学习成本(不等于没有)和超级友好的交互界面,熟练使用,绝对可以应付大多数的数据可视化工作。
我们以柱状图为例,看看EXCEL可以完成怎样的效果。
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大气臻黑版
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朴素低调版
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幻彩青春版
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动态展示版
当你有许多个因素,不同水平的数据时,可以使用power pivot 和Slicer,
可以快速查看不同实验条件之间的变化趋势
核心科技
好看的科研图表,其实和工具无关,和图表本身的设计有关,使用不同工具,只是便捷程度不同而已。
科研作图核心科技:
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字要大, 字要大, 字要大
科研图表由于一般图很小(单column的图只有3inch左右),为了保证打印出来可以简单清晰的看懂图表,要求文字一定要大,线一定要粗。而且不是文字本身要大,而是它相对于整个图片比例要大,才能获得大气、清晰的科研质感!
- 科研图表的配色一般都很正式,除了生物信息学和统计学会有花里胡哨色彩斑斓的图表外,简单的图表都非常喜欢黑白、灰阶配色,原因可能是打印出来醒目,易读,且不受黑白打印的限制。
实例操作
实不相瞒,Excel本身在科研类型的图表制作方面并不强大,不过,有科研届的大牛看不下去了,专门写了Excel插件,不仅实现了300dpi的图片导出,还可以快速应用科研图表样式,给你的图表瞬间换装!
现在,我们就来体验一下Excel和这个插件的魅力
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准备数据
比如我要检测AB两种情况下G1、G2、G3这三个基因的表达量,每个实验三个平行,数据如下
注意:这里,我们不需要进行任何统计,实验的平行不需要统计平均值和标准差,统计的事,交给下一步 -
使用Pivot Table统计
PivotTable是个Excel中比较好用的数据重塑与统计的功能,可以自动将数据分块统计。
上图中,Pivot Table就将不同的Condition 和 Gene的数据分组 , 求取每组的平均值,同理,我们还可以求标准差等!我之前的写的qPCR自动计算程序
就很大程度上依赖于这个功能
这里演示一下整个统计过程:
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出图
这里首先使用Excel画个图,然后使用大佬的Excel插件把我们的图片打扮成大人模样!而且还能灵活筛选,动态变化!
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导出
一键出图, 可导出300dpi的图片,满足出版需求。不仅可以单个导出,而且还可以批量导出,自动命名!
结语
神奇的时光总是很短暂,Excel和科研绘图插件的介绍也接近尾声,除了图标风格的设置,高质量的图标的导出,这个插件还有方差分析(ANOVA),线性回归(Linear Regression)等贴心统计功能。对于广大的科研工作者,简直香气四溢!
利用好Excel和他的周边,不断探索新功能,无论是科研还是办公领域,都可以让你有不一样的体验!
说了这么多,心动了吗,赶快在“小折线”微信公众号后台回复
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2020-07-05
Shawn
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