生信届的App Store——Bioconda

今日代码整理

• uname -a 查看服务器环境

    uname -a
    Linux VM-0-6-ubuntu 4.15.0-118-generic #119-Ubuntu SMP Tue Sep 8 12:30:01UTC 2020 x86_64 x86_64 x86_64 GNU/Linux

• wget
  从链接中下载linux软件

• bash
  运行.sh脚本

conda是个啥？

Conda 是为Python 程序创建的，适用于 Linux，OS X 和Windows，也可以打包和分发其他软件最流行的Python环境管理工具
Conda-百度百科

如何获得conda平台

• 找到链接！【搜索miniconda 清华，找到Linux latest版本
• 用wget指令获得XXXX.sh脚本文件
• 在有脚本文件的文件夹中，使用bash指令

bash Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh

• 激活！！！source ~/.bashrc conda

使用清华镜像

# 使用清华镜像
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda
conda config --set show_channel_urls yes

基础使用conda

conda list—— 查看当前服务器上安装的所有软件列表
conda search balabala——在conda中搜索balabala
conda install balabala——下载balabala
conda remove balabala——卸载balabala