RMSD，Root Mean Square Deviation；
RMSF，Root Mean Square Fluctuation。
一个是偏移，一个是涨落。
二者都是对位移的平方和再求平方根，最后求得均值。其实差别就在于，这个“均值”是哪个物理量按照什么的平均。
维基上可以查到RMSD的定义式：
RMSD
RMSF的定义如下：
RMSF
RMSF和粒子的B-factor是相关的。可以参考如下资料：
http://en.wikipedia.org/wiki/Debye%E2%80%93Waller_factor
如果用更简单的语言来表达的话，RMSD表示的是分子结构变化的程度，而RMSF值表示的是分子中各个原子运动的自由程度。
RMSD，Root Mean Square Deviation；RMSF，Root Mean Square Flu...
总结 gmx rms -f *.xtc -s *.tpr -o *_rmsd.xvg -m *_rmsd.xpm ...
(protein or nucleic) and backbone
cpptraj prmtop.cpptrajcpptraj nc.cpptrajcpptraj rmsd.cppt...
Docking A:用的cdocker将晶体复合物的配体对接回原来的蛋白质重合度不好啊，rmsd也比较高，请问大家...
计算两个小分子之间的RMSD，可以用来判断两个构象的接近程度。 第一步：安装Anaconda Win或者Linux...
产品介绍:和和是一款会员制共享平台；所有 经营者可在APP内注册和和商家成为会员供 应商（实体店、网店、微商、平台...
原文：https://blog.csdn.net/chinabestchina/article/details/7...
我年纪很小的时候，父亲有一本笔记本，上面只写了一句话：万物并育而不相害，道并行而不相悖。我当时很喜欢这句话，所以期...
? 可空类型 kotlin和Java的类型系统之间的一个很重要的区别就是，Kotlin对可空类型的显示支持 也就是...
本文标题：RMSD和RMSF
本文链接：https://www.haomeiwen.com/subject/kmxiuxtx.html
网友评论