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circRNA-miRNA-mRNA相关笔记

circRNA-miRNA-mRNA相关笔记

作者: 麦子菇娘 | 来源:发表于2022-05-05 17:10 被阅读0次

1. circbase(http://www.circbase.org/)用于查找circRNA的序列。

2. TargetScan(https://www.targetscan.org/vert_80/)用于预测miRNA和mRNA的结合位点,部分操作,具体可以下载网站的参考文献看看。

1. 选择物种并输入miRNA名称 2. 得到所有的靶基因,可以下载列表
3. 随机选择一个点击图上的sites in UTR
4.预测序列

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