featureCounts的安装
在转录组进行统计基因count数的时候，Htseq-count与featureCounts为使用最多的软件，其中htseq-count的速度较慢，而featureCounts的最大特点就是<font color='red'>快</font>。
- 下载与安装
$ wget https://jaist.dl.sourceforge.net/project/subread/subread-1.6.0/subread-1.6.0-Linux-x86_64.tar.gz
$ tar zxcf subread-1.6.0-Linux-x86_64.tar.gz
解压完成即可使用，可执行程序在bin目录。
featureCounts的使用
featureCounts的参数较多，但我们在一般情况下只需要使用常用的参数就行。
与htseq-count相同：
- -a 输入GTF/GFF基因组注释文件
- -p 这个参数是针对paired-end数据
- -F 指定-a注释文件的格式，默认是GTF
- -g 从注释文件中提取Meta-features信息用于read count，默认是gene_id
- -t 跟-g一样的意思，其是默认将exon作为一个feature
- -o 输出文件名称
- -T 线程数目
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