grep -v ^@ test.sam | awk '{print "@"$1"\n"$6"\n+\n"$7}' > test.fastq
grep -v ^@ test.sam | awk '{print "@"$1"\n"$6"\n+\n"$7}' > test.fastq
NGS文件格式 FASTQ FASTA SAM格式 FLAG标识 BAM格式
比对软件比如bowtie并不支持比对fasta格式的文件，所以需要把fasta转为fastq格式，但是fasta和...
Fastq格式作为fasta格式的延伸，提供每个碱基质量打分，常用于存储高通量测序数据。 fastq格式 fast...
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简略版，部分摘自：https://www.jianshu.com/p/386f520e5de1 SAM格式 从1开...
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本文标题：sam格式转fastq格式
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