你们不就一直说「TBtools」就是一个「打包其他软件」的工具吗

写在前面

TBtools 开发至今，也有 8 年了。不时，还是有很多人明面上或者心底里认为 TBtools 就是一个打包其他软件的程序。但事实上，300个功能，其中可能只有 20 个（10%不到的）功能调用了外部二进制程序，更不说这些二进制程序绝大多数也是专门编译成不同平台兼容的，尤其是 windows 下。很多人不会看到这些工作为多少科研工作带来多少便利。除此之外，只要愿意花点时间看看，那就会发现，TBtools 之所以有朋友愿意使用，喜欢使用，主要原因在于 TBtools 从零实现的各类功能。最简单的，那就 序列提取？GFF3 序列提取？热图？Circos图？我们就说热图好了，其中多少特性只有 TBtools 有。再找找，能有类似特性不是Copy TBtools Idea 的吗？我愿意接受，「TBtools整合了大量生物数据分析功能」，但我并不太乐意接受「TBtools整合了大量生物软件或者工具」。因为前者和后者，根本不是一个层次。更不谈，TBtoos里面还有我对计算机绘图的理解和实现 - JIGplot。
当然，我早已习惯。遇到不理解你的，笑一笑也就过去了。但是，「你们不就一直说TBtools就只是一个打包其他软件的工具」吗？那行。既然大家都喜欢说他是一个打包其他软件的工具，我就做一个「让所有人都能打包其他软件成新工具」的工具。是的，有了这个「做工具的工具」，那就所有人都能做打包其他软件的工具。同时，我给他取了一个有趣的名字「CLI Program Wrapper Creator」。既然你们要说TBtools是一个打包其他软件的工具，我就让所有人都有能力来让 TBtools 成为一个真正能打包其他软件的工具。

安装「CLI Program Wrapper Creator」

• 注意更新到 TBtools v1.099 或更高版本
  在插件商店，找到对应插件，点击 Install 即可

  
  

使用 「CLI Program Wrapper Creator」

安装完成后，可以直接在 Plugin 菜单下找到插件，随后点击打开

打开插件后，可以发现左右两边是不同面板，左边即为你设计界面的预览效果，右边即为编辑区域。
比如，我们现在有一个命令行程序可以使用，查看程序主目录

blat 类似 BLAST ，不过在不少时候，使用体验比 BLAST 更好。很多时候，我们会使用 blat 来定位某个 dna片段或mRNA甚至RNA序列（AUCG组成） 在基因组上的位置。大体命令，参考 blat 的help

大体是

blat database query -t=DbType -q=QueryType output.file.psl

参考这个命令，我们就可以在开始创作自己的工具。
首先是设置待打包的软件程序 以及 对应的依赖文件夹（对应文件或文件夹会被一并打包）

随后可以开始设置界面

摁一下回车文本框或者点击 Refresh 即可看到效果。

对应的，我们会看到 Command 文本框处，自动生成了相关命令「blat.exe [1]」。
类似的，我们可以把剩下的都设置了

逻辑上，操作过程中，你还会发现有不少人性化设计，左侧会显示那些地方是空缺的。自然的。其实你可以让元件跨行显示，如下

设置好了，我们可以直接测试插件是否可以使用。注意，在设计界面的插件完全等价于成品，是直接可以使用，不是一个纯粹的界面

此时，我们已经完成了一个插件的设计。前后只花了几分钟。
至此，可以直接导出插件。

使用你自己创作的插件

跟其他所有插件一样，直接「Install Plugin」即可安装

安装完后才能后，跟其他 TBtools 功能一样使用即可

当然，你还可以直接分享你创作的插件给你的朋友，他们也因为你的创作，可以更高效的完成生物数据分析工作。

此外

注意到界面上，有 「Load Config」和 「Save Config」选项，主要作用即导出当前设计状态，和 导入以前的设计功能。这两个选项，可以让你的设计可以随时重新优化。比如增加参数，调整界面等等。或者，你也可以和你的朋友一起优化。

写在最后

既然，他们要说我们如何，那我们就如何如何，看他们这下还能如何？
当然，「理解常常是难能可会，而不理解往往是常态」。我们做好自己，力所能及，帮到其他人，或许就可以了。管那么多干什么？
最后，欢迎所有人一起来创作自己的插件，为更多有生物数据分析但困于操作的朋友提供便利。